三藩之亂康熙六年（
1667年），吳三桂以目疾請解除總管雲貴兩省事務，康熙批准，責令雲貴兩省督撫管理。康熙十二年（
1673年）三月，平南王尚可喜疏請歸老遼東，由其子尚之信繼續鎮守廣東，清廷以尚之信跋扈難制，令尚之信撤藩。吳三桂和耿精忠於是年七月先後疏請撤兵，以試探朝廷動靜，這時朝中對於三藩的處置分成兩派，
索額圖、
圖海等以為三藩不可動，戶部尚書
米思翰、兵部尚書
明珠則贊成撤藩。康熙帝說：「三桂等蓄謀久，不早除之，將養癰成患。今日撤亦反，不撤亦反，不若先發。」
[7]康熙遂下令三藩俱撤還山海關外。
吳三桂率先舉兵反叛，以
反清復明為號召，自稱「總統天下水陸大元帥、興明討虜大將軍」，分兵攻陷
湖南、
四川。
耿精忠（耿繼茂之子）、平南王尚可喜之子
尚之信先後響應於
福建和
廣東，
廣西孫延齡、
陝西王輔臣亦反，
台灣奉明朔的
延平郡王鄭經也率大軍十五萬登陸
福建；吳三桂急派其得力大將左都督
王屏藩出兵漢中前往支援；
鄭蛟麟與王輔臣部在陝西平陽關圍殲清將
莫洛所率十萬餘人，莫洛陣亡。清廷的西線戰場形勢趨於嚴峻。康熙帝只得集中主力南征吳三桂，同時停撤平南、靖南二藩。
吳三桂起兵之初，一路勢如破竹，據雲、貴、川、湖南大部分地區，清軍的主力幾乎被吳三桂軍消滅。形勢對吳三桂有利，
劉玄初等力諫吳三桂揮軍跨過長江。但是吳軍主力一直停留在長江南岸，「劃江而守」，以致失去良機。
自康熙十五年（
1676年）起，戰場形勢開始有利於清軍，陝西的王輔臣與清廷對峙三年之後，終於接受康熙的招撫，耿精忠勢窮乞降，尚之信也繼而降清。吳三桂佔領湖南後，未趁王輔臣之響應，溯江北上，坐失戰機，而清軍則貫注全力，收復湖南大片土地。康熙十七年（
1678年），吳三桂在
衡州（今湖南
衡陽）稱帝，國號
「大周」，改元
「昭武」，大封百官諸將。當年八月十七日秋，吳三桂病死，馬寶等迎其孫
吳世璠繼承帝位，改元洪化，扶柩返回雲南。清大將軍
察尼趁吳軍軍心不穩攻擊
岳州（今湖南
嶽陽），「岳州為湖南咽喉要地，必此地恢復，則長沙、荊州之兵始能前進」，康熙十八年正月，攻佔岳州，局勢急轉直下，接連攻陷
常德、衡州等地。吳軍退據武崗、辰龍關（湖南省沅陵縣官莊鎮境內）。三月間，
勒爾錦部至辰龍關附近，但見群山林立，林深路險，
[8]不敢進兵，「急行退還」，聖祖對勒爾錦給予嚴厲申斥。
[9]。八月，岳樂、喇布等攻破武崗，十九年三月攻破辰龍關。大將軍
安親王岳樂攻克湖南長沙，大將軍簡親王
喇布收復衡州，
傅宏烈等部收復桂林，甘陝清軍收復漢中、重慶、成都。康熙十九年（
1680年）十月，
吳世璠退回昆明。至此湖南、貴州、廣西、四川等省被清軍次第收復。
康熙十九年（
1680年）三月趙良棟建議自湖南、廣西、四川三路合擊，進取雲貴。康熙二十年（
1681年），
雲貴總督蔡毓榮主攻，統合定遠平寇大將軍
彰泰、
賴塔等從蜀、黔、桂三路入雲南，佔五華山，圍昆明城，至十月，城內糧食不繼，文武大臣紛紛投降。十月
趙良棟指揮所部綠營兵率先攻破昆明，餘眾將從攻湧入，二十八日吳世璠絕望自殺，十月二十九日吳軍出城投降。
[10]王屏藩和
陳君極自縊死。被俘的
吳之茂、
韓晉卿、
張起龍等解送北京。
[11]至此歷時8年，蔓延10省的三藩之亂才平定下來。三藩之亂的平定，穩固了滿清政局。此後攻取明鄭的
思明州，使前明故土完全納入清廷的掌控，以及往後
康雍乾三帝疆域的拓展，「
康乾盛世」也由此開端。
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